Wykonanie tomografii komputerowej wymaga użycia promieniowania jonizującego, a w wielu przypadkach także zastosowania jodowych środków kontrastowych. Z tych względów istnieją przeciwwskazania do wykonania tomografii komputerowej.

Obwieszczenie Ministra Zdrowia z dnia 31 grudnia 2014 r. w sprawie ogłoszenia wykazu wzorcowych procedur radiologicznych z zakresu radiologii – diagnostyki obrazowej i radiologii zabiegowej (Dz.U. 2014 poz. 85) określa bezwzględne i względne przeciwwskazania medyczne do zastosowania procedur tomografii komputerowej:
1) względne:
a) ciąża,
b) kobiety w wieku rozrodczym po 10 dniu cyklu miesięcznego,
c) dzieci i młodzież,
d) osoby z uczuleniem na środek kontrastujący w wywiadzie,
e) niewydolność nerek (poziom kreatyniny powyżej 1,5 mg%),
f) planowana terapia jodem promieniotwórczym;
2) bezwzględne:
a) udokumentowany wstrząs anafilaktyczny po podaniu środka kontrastującego.

Obwieszczenie doprecyzowuje również wymagania dotyczące postępowania z kobietami w ciąży, karmiącymi piersią, jeżeli procedura tego wymaga, oraz z osobami poniżej 16 roku życia, ze szczególnym uwzględnieniem niemowląt: Kobiety w ciąży jedynie ze wskazań życiowych, przy braku możliwości wykonania rezonansu magnetycznego. Konieczne zastosowanie odpowiednich osłon. U kobiet karmiących badanie nie jest przeciwwskazane. U osób poniżej 16 roku życia tylko przy braku możliwości wykonania badania rezonansu magnetycznego.

Źródło:
Agencja Oceny Technologii Medycznych i Taryfikacji. Raport w sprawie ustalenia taryfy świadczeń nr WT.541.34.2016